向日葵在生长前期有时候会出现分枝(分杈)的现象，很多人把这种情况简单的归咎于种子的“纯度”问题，其实只要购买正规公司的杂交种，种子纯度都是符合国家标准的。向日葵分枝出现的最主要原因是受到了生理胁迫，绝大多数的分枝会随着向日葵生长而自动脱落，但是若受到极端气候影响导致向日葵分枝情况严重，有条件应采取打杈措施。
向日葵出现分枝的主要原因：
1 、生育前期低温冷害，造成生长发育迟缓，易产生分枝。
2 、8～12片叶期间及现蕾前，在一定的干旱过程后，突然灌水或降雨会造成营养运输失衡，引发及促进腋芽分化，长出分枝。
3 、向日葵的根系发育与地上部分的发育是通过维管束相互影响的，当田间作业农机具（犁铧）造成向日葵须根受损时，可能出现分枝。
4 、单株营养面积过小，营养不足土地瘠薄也可能造成营养分枝出现。
5 、播种时不带种肥，苗期不松土、不追肥、定苗过晚等，都可能使植株在营养生长阶段发育不正常。株高0.8～1.2m，即开花，限制了株高增长，若采取“一炮轰”的大水大肥，也会造成分枝的出现。
6 、土壤缺硼主茎生长不良，腋芽常随之分化，造成分枝。